Kaksi tutkimatonta tutkimusta johtaa CRISPR-Cas12a-inhibiittoreiden havaitsemiseen

Anonim

Kaksi ryhmää, jotka toimivat toisistaan ​​riippumattomasti, ovat tunnistaneet useita CRISPR-Cas12a-inhibiittoreita. Ensimmäinen joukkue koostui jäsenistä Kalifornian yliopistosta, Berkeleystä, toisella oli Massachusettsin yleiskeskuksen ja Kalifornian yliopiston jäseniä. Molemmat ovat käyttäneet bioinformatiikan työkaluja bakteerigenomien tutkimiseen mahdollisille estäjille ja molemmat ovat julkaisseet tuloksensa lehdessä Science .

CRISPR on geeninmuokkaustekniikka, joka tunnistaa DNA-segmentit ja erottaa ne genomista. Sitä voidaan käyttää myös leikattavien segmenttien korvaamiseen. Tehtäviensä suorittamiseksi CRISPR käyttää proteiinisukleaasia, joka toimii ohjeena tai mallina, jossa kuvataan, mitkä geenit leikataan ja / tai korvataan. Cas9, jota usein käytetään tähän tarkoitukseen useissa varhaisissa tutkimuksissa, liittyi tekniikkaan. Mutta Cas9: n toimimaan oikein, tutkijat joutuivat myös lisäämään Cas9-estäjiin - sen tehtävänä oli estää ulkomaalausleikkaus. Hiljattain tutkijat ovat käyttäneet Cas12a: ta, koska se tarjoaa muita haluttuja ominaisuuksia, joita ei löydy Cas9: sta. Tähän asti Cas12a ei ollut tunnettuja inhibiittoreita, jotka estivät sen käytön tutkimuspyrkimyksissä. Näissä kahdessa uudessa ponnistuksessa molemmat joukkueet ovat löytäneet useita inhibiittoreita, joita he väittävät olevan sopivia käytettäväksi CRISPR: n kanssa.

Molemmat ryhmät käyttivät bioinformatiikka-pipeline-lähestymistapaa etsimään Cas12-estäjiä - se on järjestelmä bakteerigenomien etsimiseksi, johon liittyy geneettisten fragmenttien etsiminen, jotka ovat normaalisti tappavia bakteereille, mutta jotka eivät ole kohti bakteereja, joilla on inhibiittoreita. Käyttämällä tätä lähestymistapaa, ensimmäinen joukkue löysi kolme inhibiittoria, joista yksi erottui nimeltä AcrVA1. Testaus ihmissoluilla osoitti, että kaikkia kolmea voitiin käyttää CRISPR: n kanssa. Käyttämällä samaa perustavaa laatua olevaa lähestymistapaa, toinen ryhmä löysi useita ehdokkaita, jotka myös toimivat toivottavina testattuna ihmissoluilla. Toinen joukkue totesi myös, että AcrVA1 on erityisen tehokas.

Yhdessä, kahden ryhmän työ on tuottanut useita mahdollisia Cas12a-inhibiittoreita, joista yksi näyttää olevan erityisen lupaava. Ja tämä voisi johtaa hedelmällisempään tutkimukseen käyttämällä CRISPR-Cas12a: ta uutena geenien muokkaustyökaluna.

menu
menu