Uusi tekniikka voi havaita satoja proteiineja yhdessä näytteessä

Zeitgeist: Moving Forward (2011) (Huhtikuu 2019).

Anonim

McGill University -tieteen tutkijoiden kehittämä uusi teknologia mahdollistaa virtaviivaisten proteiinien analysoinnin ja tarjoaa nopean, suuren volyymin ja kustannustehokkaan työkalun sairaaloille ja tutkimuslaboratorioille.

Veressä olevat proteiinit tarjoavat tutkijoille ja lääkäreille tärkeitä tietoja terveydestämme. Nämä biologiset markkereet voivat määrittää, onko rintakipu sydäntapahtuman aiheuttama vai potilaan syöpä.

Valitettavasti tällaisten proteiinien havaitsemiseen käytettävät työkalut eivät ole kehittyneet paljon viimeisten 50 vuoden aikana - huolimatta siitä, että elimistössä on yli 20 000 proteiinia, valtaosa nykyisin käynnissä olevista proteiinitesteistä kohdistaa vain yhden proteiinin kerrallaan.

Nyt, Ph.D. ehdokas Milad Dagher, professori David Juncker ja kollegat McGillin lääketieteellisen tekniikan laitoksessa ovat kehittäneet tekniikan, joka pystyy havaitsemaan satoja proteiineja yhdellä verinäytteellä.

Osa töistään, joka julkaistiin juuri Nature Nanotechnology -tuotteessa, kuvaa uutta ja parannettua tapaa viivakoodi-mikrohelmiin käyttäen monivärisiä fluoresoivia väriaineita. Ylläpitäen 500 eri värillistä mikrohelmiä, niiden uusi viivakoodauslaite mahdollistaa markkereiden havaitsemisen rinnakkain samasta ratkaisusta - esimerkiksi sinistä viivakoodia voidaan käyttää havaitsemaan merkkiaine 1, kun taas punaisella viivakoodilla voidaan havaita merkkiaine 2 ja pian. Laserspohjainen instrumentti, jota kutsutaan sytometriksi, laskee sitten proteiinit, jotka tarttuvat eri värillisiin helmiin.

Vaikka tällainen analyysimenetelmä on ollut jonkin aikaa käytettävissä, moniväristen väriaineiden häiriö on rajoittanut kykyä tuottaa oikeat värit. Nyt tiimin kehittämä uusi algoritmi mahdollistaa mikro-helmien erilaiset värit suurella tarkkuudella, kuten värirenkaalla voidaan ennustaa värisekoituksen tuloksia.

Professori Junckerin ryhmä toivoo voivansa hyödyntää alustansa parempien proteiinien analysoimiseksi.

"Nykyiset teknologiat pitävät suurta kompromissia kerralla mitattavien proteiinien määrän ja testin kustannusten ja tarkkuuden välillä", Dagher selittää. "Tämä tarkoittaa sitä, että laajamittaiset tutkimukset, kuten kliiniset tutkimukset, eivät ole tehottomia, koska niillä on tapana palata kokeiltuihin tosialustoihin, joilla on rajoitetut valmiudet."

Heidän tulevassa työssä keskitytään pitämään tarkkoja proteiinien havaitsemista entistä laajemmin.

Milad Dagher, Michael Kleinman, Andy Ng ja David Juncker julkaistiin Nature Nanotechnology -tuotteella. "FRET-mallin monivärinen FRET-malli mahdollistaa viivakoodauksen äärimmäisissä FRET-tasoissa".

menu
menu